Графин
Россия, Дальний Восток

Фамилия Яковлев, при регистрации фамилий в России, образовалась как указание, что отца человека звали Яковом, то есть он —　«Яковлев сын».

В России нередко называли детей и некоторыми именами, встречавшимися в Библии (имею в виду, конечно, еврейскую Библию), либо — в книгах христианской религии,　где авторы определяли некоторых «действующих лиц», как евреев. Соответственно, с еврейскими именами (иногда, впрочем,　искаженными, в греческом произношении).

Имя Яков (на иврите — Яаков) и было одним из таких имен. Поэтому в России фамилия Яковлев указывает, скорее всего, на нееврейское происхождение.

Впрочем, в любом случае, фамилии наследуются от отца. А в еврейской традиции принадлежность к еврейскому народу определяется по материнской, но не по отцовской линии.

См. на сайте, к примеру, ответы «Бабушка — еврейка. Являюсь ли я евреем?»  и «Кто определил: отец — еврей, сын — нееврей?».

«Физиологические черты», как Вы выразились, в вопросе о принадлежности к еврейскому народу, никакого значения не имеют (см. на сайте, примеру, ответ «Я и мой дядя — вылитые евреи»).