В Вашем вопрос речь идет об одной из 39 категорий работ (действий), которые запрещается производить в шаббат. Эта категория носит название борер, что в переводе с иврита означает — «сортирует», «выбирает» и т.п.

Нельзя, например, выбирать из пищи нежелательные, непригодные для еды элементы (кости, косточки, шелуху и т.п.). Но при этом разрешается выбирать то, что мы можем и хотим съесть (снимать, скажем, мясо с кости, колоть орехи, чтобы съесть ядро и т.д.).

Точно так же можно в шаббат есть семечки — раскалывая зубами оболочку, съедая семечко и выбрасывая шелуху. Но нельзя сначала счищать шелуху, а потом съедать семечко.

Кроме того, важно подчеркнуть, что шелуху от семечек или скорлупу от орехов следует складывать в тарелку. Нельзя класть эти «отходы» прямо на скатерть или, что еще хуже — бросать на пол. Таково требования ѓалахи (еврейский практический закон). Этических и эстетических правил поведения, согласно которым, как очевидно, шелуху и скорлупу необходимо складывать в тарелку, я здесь не касаюсь.

Попутно отмечу, что мы говорим о действиях, предпринятых непосредственно перед тем, как мы приступаем к употреблению требующего очистки блюда или продукта (от момента очистки до еды должно пройти не более нескольких минут, к примеру — до пятнадцати). Ибо в шаббат нельзя готовить такие блюда заранее — даже описанным здесь способом. Нельзя, например, в субботу наколоть орехов за час или два до того, как их будут есть. Это уже рассматривается как запрещенное в шаббат действие категории борер — даже если съедобная часть вынимается из несъедобной.

Подробнее об этом можно прочесть в Кодексе еврейских законов Шульхан Арух (раздел Орах Хаим, параграфы 308, 309 и 321; с комментариями Мишна Берура).

В реализации законов, касающихся категории борер, есть много нюансов, рассказать о которых в узких рамках наших ответов невозможно. Поэтому рекомендую изучить их, пользуясь ѓалахическими сборниками «Хазон Иш» (параграфы 340 и далее) и «Ялкут Йосеф» (том 4, часть 3, стр. 250-330).